随着疫苗问世和两岸疫情趋缓，金门县府向民间当局提出“金厦防疫泡泡”方案，希望金厦“小三通”逐步恢复正常往来，具体建议是初期每2周试行1班往返，载客数上限是77人，开放对象则以有人道、就学和工作需求的金门乡亲与陆籍配偶为主。

县府以目前逐渐进入后疫情时期，且金门始终保持零确诊，厦门也有天以上无本土病例，两岸疫情朝向乐观发展，因此在3月15日由县长杨镇浯带队赴陆委会，向主委邱太三提出“金厦防疫泡泡”方案，建议在金厦两门做好防疫措施的前提下，以金厦先试先行的精神逐步恢复“小三通”客船往来。

但杨镇浯县长拍板全案低调进行，在陆委会3天后突然对媒体透露此事，才赶紧跟进发布新闻稿，但仅简单和含糊说明行程、县府立场，以致关心“小三通”新进程的乡亲搞不清楚陆委会和县府到底在吹什么泡泡？因此怨言四起，甚至忧心县府像一头牛被民进党牵着鼻子走，未能反映地方的实际需求，一点作为也没有。

直到今天有媒体曝光县府提出的“金厦防疫泡泡”方案内容后，县府始透过观光处大陆事务科证实具体内容就是初期每2周试行1班往返，且基于防疫能量考量，载客数上限是77人，开放对象则以有人道、就学和工作需求的金门乡亲与陆籍配偶为主。

县府也说明，初步规划申请者应备妥核酸检测证明等文件，入境者需依台湾疫情指挥中心规范，进行相关管控与隔离，落实必要的防疫措施。

县府并强调，“金厦防疫泡泡”方案实际推动方式、方向与期程，尚需考量两岸疫情状况、防疫能量与管控措施，由流行疫情指挥中心与陆委会综合评估与政策拍板，届时，县府团队将全力配合，务必在落实完整的防疫配套措施下，逐步恢复两岸小三通客运往来，协助金门的百工百业与乡亲安居乐业。